lunes, 14 de julio de 2014

Curso de Isótopos Estables en la UEUQ


En el mes de junio pasado realizamos en la Unidad de Enseñanza Universitaria Quequén (UEUQ),  Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires (UNCPBA) el curso Isótopos Estables en Arqueología y Ecología. El mismo estaba enmarcado en el Doctorado en Arqueología de la Facultad de Ciencias Sociales (UNCPBA).

De este curso participaron 26 estudiantes provenientes de Argentina, Chile, Colombia y Uruguay.  Estos representaban numerosas disciplinas (Arqueología, Ecología, Ingeniería Agronómica, etc.) y muchas etapas en el desarrollo de un científico, desde estudiantes de Doctorado iniciando sus proyectos hasta postdocs y jóvenes investigadores.
Participantes y colaboradores

Desde mi punto de vista el curso fue muy bueno, he aprendido mucho y se que cosas hay que mejorar para una edición futura. El entusiasmo de los estudiantes fue muy bueno, tanto para hacer preguntas como para interactuar entre ellos. Sin lugar a dudas la energía que trajeron me sirve para motivarme a ofrecer este curso otra ves y para desarrollar algún otro, sea en el mismo formato o en algún formato mas corto e interactivo (tipo taller o simposio).


 Durante una clase teórica

Observando la toma de muestras de esmalte dental

 
Procesando apatita

Quiero resaltar el apoyo del Doctorado en Arqueología (especialmente a Marcos Rodriguez) y de la UEUQ, pero principalmente de los miembros del Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana (LEEH) quienes hicieron posible todo la logística del curso; Pamela García Laborde, Marilina Martucci, Josefina Motti, Manuel D’Angelo y Ricardo Guichón. Muchas gracias!

Además quiero agradecer a todos los estudiantes que confiaron su tiempo y recursos en mí y en este curso!! Muchas gracias!!!


Los estudiantes trabajaron en grupo y el último día 
realizaron presentaciones de sus trabajos grupales



Evaluación
Los estudiantes contestaron, en forma anónima, una encuesta para el Doctorado en Arqueología, a continuación escribo a modo de síntesis algunas de sus opiniones sobre el curso:

Clases teóricas
Muy Bueno
Bueno
Regular
Malo
ns/nc
Desarrollo de los contenidos
23
2



Desarrollo de las clases
24
1



Comprensión de las consignas
19
6



Acceso a la bibliografía
23
2



Actitud del Docente
25
0



Medios audiovisuales
19
6



Salidas de campo (si las hubo)




5
Otros


1

2


En cuanto a las dificultados que se presentaron durante el curso, ocho estudiantes dijeron que la falta de accesos a internet fue un problema, tres que era necesario una base en el tema (isótopos estables) o en química, y uno que la temática fue muy amplia.

Además, en los comentarios algunos estudiantes sugirieron tener una clase completa de uso del software (n =1), mejorar la sección practica (n = 1), realizar practicas especificas con formulas y cálculos (n = 2) e incluir el curso como nuclear en el segundo cuatrimestre (n = 2, esto último no lo entendí muy bien, por que no fueron muy claros si hablaban de este curso o en general de cursos para el Doctorado en Arqueología).

Sobre como se habían enterado del curso:
            Por correo institucional de FACSO: 6
            Por la página web del Doctorado: 7
Por otro medio: 12 (5 Facebook, 3 Agenda CONICET, 4 por difusión del docente)
Por comentario de otra persona: 7


Espero tener pronto noticias sobre la organización de una nueva edición de este curso o de algún otro similar!


lunes, 9 de junio de 2014

Paper Nuevo: Deconvolución de señales isotópicas


En este paper publicado en Oecologia describimos el problema asociado al analizar múltiples pelos en un mechón, y como la señal isotópica de cada pelo se "mezcla" para generar una señal promedio dependiente de la etapa de crecimiento de cada pelo y de su tasa de crecimiento. Presentamos un modelo matemático de deconvolución para recuperar la señal "original" en equilibrio. Este modelo es aplicable a otros tipos de muestra, no solo pelos, y también a otros tipos de señales como la concentración de drogas y metabolitos, por ejemplo.

Este trabajo fue parte de la tesis doctoral de Chris Remien, dentro del programa de Doctorado de Matemática aplicada a la Biología (Graduate Studies in Mathematical Biology) de la Universidad de Utah, y representa una de las tantas colaboraciones multidisciplinarias del laboratorio del Dr. Jim Ehleringer.

Remien, Christopher H., Frederick R. Adler, Lesley A. Chesson, Luciano O. Valenzuela, James R. Ehleringer, and Thure E. Cerling. “Deconvolution of Isotope Signals from Bundles of Multiple Hairs.Oecologia, May 3, 2014, 1–9. doi:10.1007/s00442-014-2945-3.

Abstract
Segmental analysis of hair has been used in diverse fields ranging from forensics to ecology to measure the concentration of substances such as drugs and isotopes. Multiple hairs are typically combined into a bundle for segmental analysis to obtain a high-resolution series of measurements. Individual hair strands cycle through multiple phases of growth and grow at different rates when in the growth phase. Variation in growth of hair strands in a bundle can cause misalignment of substance concentration between hairs, attenuating the primary body signal. We developed a mathematical model based on the known physiology of hair growth to describe the signal averaging caused by bundling multiple hairs for segmental analysis. The model was used to form an inverse method to estimate the primary body signal from measurements of a hair bundle. The inverse method was applied to a previously described stable oxygen isotope chronology from the hair of a murder victim and provides a refined interpretation of the data. Aspects of the reconstruction were confirmed when the victim was later identified.

Disponible en:


miércoles, 17 de julio de 2013

Paper Nuevo: Isótopos y perros, dieta y salud!

En este paper publicado en el Open Journal of Animal Science presentamos un análisis retrospectivo de la dieta y actividad física de perros de la raza "Perro de Agua Portugués" usando mediciones de isótopos estables (C, N, S) de huesos y dientes y de variables de "robustez" del cráneo. Estas mediciones son evaluadas y correlacionadas con mas 53 variables morfométricas del cuerpo y de los órganos, y con variables histopatológicas de mas de 200 perros fallecidos de forma natural.

Este trabajo se enmarca en un colaboración con el laboratorio del Dr. K. Gordon Lark, quien hace muchos años esta trabajando con perros (de muchas razas) para estudiar las determinantes genéticas y ambientales (incluyendo dieta) de la variabilidad morfométrica y del estado de salud al final de la vida de estos perros. Lark research.

“Alas poor Yorick”: What retrospective analysis of canine skulls can tell us about the impact of  environmental factors on health.

Luciano O. Valenzuela, Kevin Chase, Lawrence McGill, Shawn Miller, Mark Nielsen, Karl G. Lark

Abstract: Necropsies and extensive histological evaluation for clinical and sub-clinical disease of approximately three hundred Portuguese Water dogs are available as part of an ongoing study to assess their state of health at the end of life. Throughout life these dogs enjoyed a variety of lifestyles and environments. Here we carry out retrospective quantitative assessments of life-time dietary input and physical activity for each dog. To do this, collagens from skull vault bone and from dentine have been analyzed for ratios of stable isotopes to determine differences in diet that individual dogs experienced during late or early life respectively. Robustness of skull bone (weight/unit of skull size) was used as a relative indicator of the amount of physical activity experienced during a dog’s lifetime. These environmental parameters were correlated with the frequency and severity of specific disease processes determined at necropsy. Both measures were shown to exert significant low-level (r < 25%) differential effects on specific diseases. The value of retrospective analysis of environmental influences is discussed.

Keywords: Portuguese Water Dog; Necropsy; Histopathology; Exercise; Nutrition; Stable Isotope; Skull; Dentine; Collagen


Valenzuela LO, Chase K, Nielsen M, McGill L, Lark KG. (in press). "Alas poor Yorick": What retrospective analysis of canine skulls can tell us about the impact of environmental factors on health. Open Journal of Animal Science. 3:12-18. doi: 10.4236/ojas.2013.33A002. 


¿Que significa "Alas poor Yorick"?  Leer aquí

 

viernes, 10 de mayo de 2013

Conferencia Internacional de Zooarquelogía (ICAZ)

Del 22 al 27 de Septiembre del 2014 se realizara en San Rafael, Mendoza la XII Conferencia Internacional de Zooarquelogía (ICAZ).


Si bien esta conferencia no es de isótopos estables, seguramente el tema de los isótopos sera un tema recurrente en las presentaciones y conversaciones! (y aunque falta un tiempo que bueno para ir a un congreso muy lindo, y visitar Mendoza!!!)

El congreso se llevará a cabo en el Centro de Exposiciones y Convenciones de San Rafael. En la página web www.icaz2014argentina.com puede chequear las últimas novedades y toda la información necesaria para asistir al congreso.

IMPORTANTE: el 30 de Junio vence la posibilidad de enviar propuestas de simposios.

Cualquier consulta o sugerencia hacerla al info@icaz2014argentina.com 

Ademas también en Facebook: ICAZ 2014 San Rafael.

El comité organizador agradece se distribuya esta información entre potenciales interesados.




jueves, 25 de abril de 2013

Iso-Cambios

Hace poco mas de dos años que se lanzaba este pequeño blog (Marzo de 2011). Hoy, luego de este tiempo, hemos tenido mas de 8000 páginas visitadas y mas de 3000 visitantes de 45 países diferentes*. Además, la lista de e-mail relacionada el blog (isesecol-ar), aunque un poquito mas vieja (2008), tiene mas de 110 miembros pertenecientes al menos a 9 países diferentes.

Creo es un buen momento para reafirmar el objetivo de este blog (la parte iso) y para comentar algunos cambios.

En los últimos meses, luego de charlar con muchos estudiantes e investigadores en forma personal (principalmente luego de haber participado del curso en Uruguay y de dar una charla en Colombia) o contestando varios e-mails por semana, he reafirmado algo que pensaba ya hace un tiempo: 1) hay muchísimo interés en Latinoamérica con respecto al uso de isótopos estables en ecología (y áreas relacionadas) y el uso de la técnica esta creciendo a pasos agigantados, pero ademas 2) hay una necesidad muy grande de formación (educación), tanto sobre los principios básicos de los isótopos estables, como sobre sus análisis, preparación de muestras, interpretación de resultados, etc. Es una pena que esta falta de conocimiento en algunos aspectos claves lleve a errores graves, al punto de comprometer la culminación exitosa de tesis de grado y de postgrado, o la pérdida de tiempo y fondos en investigaciones que, para empezar, no tienen mucho de ambos. Es fundamental entonces incrementar la educación y el conocimiento, sobre isótopos estables, de aquellos investigadores y estudiantes trabajando o por trabajar con esta técnica. El desarrollo de cursos o workshops (sean eventos físicos o 'virtuales') es muy necesario, pero también lo es el acceso y la lectura del material apropiado. Ademas, desde mi punto de vista, los laboratorios que prestan servicios de análisis deberían ser responsables de generar parte de esta educación, para que sus usuarios estén bien informados y educados y así reducir errores y dolores de cabeza!! Creo también que es muy importante la educación o difusión "informal" y el intercambio de ideas y experiencias entre investigadores, por ejemplo a través de comunicaciones por listas de corre electrónico (isesecol-ar) o en paginas de internet.

Si bien yo soy quien sube los posts (bitácoras) al blog, aprovecho esta oportunidad para reiterar que la idea fundamental de este blog es facilitar la comunicación entre investigadores interesados en la aplicación de isótopos estables. Considero que todavía podemos hacer mas para mejorar esta disciplina. Para eso reitero lo que escribí en el primer post en el año 2011. "Una de las cosas mas importantes para que este sitio sea exitoso es la participación y el feedback de aquellos interesados. Por lo tanto les pido que si tienen ideas para mejorarlo me manden un e-mail (a mi o a la lista) o dejen comentarios en el blog. Sería interesante saber que tipo de información es mas relevante para esta pequeña comunidad y saber cuales son sus necesidades. Por ejemplo: ¿Sería útil tener una lista (con datos de contacto y descripción de su investigación) de investigadores (de Sudamérica) que trabajan con isótopos? ¿Sería útil tener una comunidad de investigadores (voluntarios) que lean nuestros borradores de papers y grants antes de ser enviados?  ¿Sería útil tener una lista de costos de análisis basada en la experiencia de los usuarios?  ¿Sería útil tener na lista de papers y libros recomendados?  Llevar a cabo todas estas significa bastante trabajo, así que priorizar lo que esta comunidad necesita es importante." Ademas, repito lo que dije en algún otro momento quienquiera escribir un post en el blog me avisa, el blog esta abierto a todos!!!

En otro orden de cosas, quiero comentar que en estos días he dejado de trabajar en el laboratorio del Dr. Ehleringer (y en SIRFER) (aunque seguiré ligado como colaborador por mucho tiempo) y dentro de poco estaré empezando una nueva etapa como investigador en Argentina (CONICET). Se vienen muchos cambios y espero que sean para mejor. A pesar de estos cambios, espero continuar con la actividad del blog, de la lista isesecol-ar, con el grupo de facebook y la cuenta de twitter.

Un gran saludo,
Luciano


* Estos números no son exactos ya que existe redundancia en las estadísticas tomadas por blogspot (Google) y por Neocounter.